1989 yazında Boko, Joe, Junichi ve Brody, Tokyo’da sıradan günler geçirir. Şehrin ortasında dev ve insan yiyen yaratıklar ortaya çıkınca kaçacak güvenli bir yer bulamazlar. Tam umutları tükenirken kaplumbağaya benzeyen dev Gamera saldırıya geçer. Gamera, çocukları korumak için yaratıklarla savaşır. Boko ve arkadaşları bu çatışmanın ortasında hayatta kalmaya çalışırken Tazaki de yaşananların kaynağını araştırır. Canavarların peş peşe gelmesi, Tokyo’yu büyük bir savaş alanına çevirir. Çocuklar Gamera’ya güvenmek zorunda kalır, fakat her yeni saldırı daha büyük bir tehlike getirir. Gamera onları bu ölümcül yaratıklardan korumayı başarabilecek midir?