3 Küçük Ninja, yaz tatilinde ninjalık eğitimi alan üç kardeşin, babalarını oyalamak isteyen bir silah tüccarının adamlarına karşı kendilerini korumaya çalışmasını anlatıyor. Samuel, Jeffrey ve Michael, Japon dedeleri Mori Tanaka’nın yanında kalırken dövüş, dayanıklılık ve dikkat üzerine eğitim alıyor. Başta eğlence gibi görünen bu günler, onları daha becerikli hale getiriyor. Bu sırada FBI ajanı olan babaları Victor Wong Chi-Keung, tehlikeli bir silah tüccarını izliyor. Wong, babanın dikkatini dağıtmak için çocukları hedef alıyor. Ama üç kardeş, öğrendikleri ninja becerileriyle onları komik ve yaratıcı yollarla durdurmaya çalışıyor. Yönetmen: Jon Turteltaub.