Ajanlar İş Başında, bir ajan ile genç bir mucidin, tehlikeli bir düşmanın peşinde yaşadığı dönüşüm ve kaçış hikayesini anlatıyor. Lance Sterling, Katsu Kimura’dan bir saldırı uçağını geri almak için görevlendirilir ve Walter Beckett ile karşılaşır. Walter, ona daha sakin yolları anlatmaya çalışır ama Lance onu dinlemez. Lance, boş çıkan evrak çantasının ardından Marcy ile karşılaşır. Walter’ın hazırladığı karışımı yanlışlıkla içince güvercine dönüşür. Walter, onu eski haline çevirmeye uğraşırken ikili şehirde kovalanır. Ardından Kimura’nın izini Playa del Carmen’e kadar sürerler. Bu sırada Killian, Marcy ve OGBC’den önce Venedik’teki hedefe ulaşmak ister. Walter panzehir hazırlamaya çalışır ama işler yolunda gitmez. Lance, bu halde görevi tamamlayıp kendini kurtarabilecek midir?