Alien Uprising'te, gökyüzünde beliren büyük ışıkların ardından şehirde iletişim kesilir. Carrie, Michael, Robin, Kenny ve George, bir UFO içinde ne olduğunu anlamaya çalışarak sokaklara çıkar. İnsanlar panikle kaçışırken ekip askerlerin kurduğu kontrol noktalarından uzak durmaya çalışır. Gökyüzündeki varlıkların ne istediğini çözmek için birbirlerine sorular sorarlar. Şehirde güven her geçen dakika azalır, dışarıdan gelen tehdit büyür. Grup, kendi arasındaki anlaşmazlıklarla da uğraşır. Carrie ve Michael yön bulmaya çalışırken, Robin ve Kenny daha çok kaçış yolu arar. George ise onları ayakta tutmaya çalışır. Hepsi, kapalı kalan şehirde hayatta kalacak bir çıkış bulmak zorundadır.