Amerikan Ninja, Filipinler’de görev yapan bir Amerikan askerinin, kaçırılan bir kızı kurtarmak ve üstüne çöken çeteye karşı hayatta kalmak için verdiği mücadeleyi anlatıyor. Joe Armstrong, orduda bir dövüşçü olarak görev yapar. Bir gece birliği saldırıya uğrar, silahlar çalınmak istenir ve Patricia kaçırılır. Joe peşlerine düşer, iz sürer ve kızı geri almayı başarır. Bu sırada arkadaşlarını kaybeder. Cpl. Curtis Jackson rolünde Steve James var. Patricia Hickock rolünde Judie Aronson var. Ancak çete lideri bununla yetinmez, Joe’yu durdurmak için ninja savaşçılarını devreye sokar. Joe, hem Patricia’yı korumaya hem de gelen yeni tehditle baş etmeye çalışır.