The Swarm, Libya’da öldürülen 21 Mısırlının ardından Mısır ordusunun terörist gruplara karşı yürüttüğü operasyonları anlatıyor. Olaylar, güvenlik güçlerinin sahadaki hücreleri bulmak için istihbarat toplamasıyla başlamaktadır. Elde edilen bilgilerle planlar hazırlanmakta, ardından hedef noktalara baskınlar düzenlenmektedir. Çatışmalar, askerlerin farklı bölgelerde iz sürdüğü ve grubun hareket alanını daraltmaya çalıştığı anlarla ilerlemektedir. Ahmed El Sakka’nın Ali el-Mısri, Sherif Mounir’in Şerif el-Mısri olduğu hikâyede, istihbarat başındaki isim de süreci yakından yönetmektedir. Mostafa Fahmy, Ahmed Hatem ve Karim Fahmy de bu operasyonların içinde yer alan kilit kişilere odaklanmaktadır. Ancak her adımda yeni bir risk ortaya çıkmakta, ekipler hedefe ulaşmak için daha dikkatli hareket etmek zorunda kalmaktadır.