Auschwitz'in Meleği'te, Doktor Gisella Perl Auschwitz toplama kampında jinekolog olarak çalışmaya zorlanır ve kampın doktoru Josef Mengele’nin baskısı altında her gün yeni bir korkuyla yüzleşir. Gece olunca dinlenemez, deneylere maruz kalan mahkumlara gizlice yardım etmeye çalışır. Kampta Stanislawa Leszczynska ile tanışır, Klara rolüyle Hayley-Marie Axe ve Stanislawa Leszczynska rolüyle Noeleen Comiskey hikayenin ortalarında belirir, iki kadın doğum yapan kadınlara destek olmak için birlikte hareket eder. Bu süreçte yaklaşık 3 bin bebeğin dünyaya gelişine tanıklık ederler. Tifo yayılırken Mengele, yeni doğanları ve annelerini de deneylerinde kullanmaya devam eder, Gisella ise hayatta kalmak için çaresizce mücadele eder.