Balta 3, Marybeth’in Honey Island Bataklığı’nda Victor Crowley’nin bıraktığı izleri takip edip onu durdurmaya çalışmasını anlatıyor. Marybeth polise teslim olduktan sonra, bataklıkta yaşanan saldırıların sürdüğünü öğrenmektedir. Olayların arkasındaki vudu büyüsünü çözmek için harekete geçmektedir. Bu sırada sheriff Fowler, Amanda ve Hawes’ın yer aldığı arama kurtarma ekibi bataklığa gönderilmektedir. Ekip, dar geçitlerde yol alırken Crowley’nin saldırısıyla karşılaşmaktadır. Marybeth de ekibe ulaşmaya çalışmakta, karşısına çıkan her engelde izini sürdüğü tehlike daha da büyümektedir. Bataklık içinde ilerledikçe, ekip hayatta kalmak için birbirine bağlı kalmak zorunda kalmaktadır.