Balto'te, Alaska’nın Nome kasabasında çocuklar arasında tehlikeli bir difteri salgını başlar. Yoğun kar fırtınası yolları kapatır ve kasabaya ilaç ulaştırmak imkansız hale gelir. Çözüm için kızak köpekleri kuzeyin dondurucu koşullarında uzun bir yolculuğa çıkar, ama tipi yüzünden yönlerini kaybederler. Balto, bu zorlu anda öne çıkar ve antitoksini kasabaya ulaştırmak için elinden geleni yapar. Ona Jenna, Boris, Steele, Muk ve Luk da eşlik eder. Kasabada herkes zamanla onun cesaretine ve dayanıklılığına güvenmeye başlar.