Batman: Kırmızı Başlığın Altında, Gotham’da ortaya çıkan gizemli Red Hood’un peşine düşen Batman’in eski bir dostla hesaplaşmasını konu alıyor. Şehirde suç örgütlerini kendi kurallarıyla bastırmaya başlayan Red Hood, Batman’i sert bir takip içine çekmektedir. Kısa süre sonra bu maskeli kişinin eski Robin olduğu anlaşılmaktadır. Robin’e hayat veren Jensen Ackles, Ra’s al Ghul tarafından yeniden hayata döndürülmüş, fakat aldığı yaralar ve yaşadığı dönüşüm onu Batman’den uzaklaştırmıştır. Red Hood, Gotham’ın yeraltı dünyasında etkisini artırırken Joker de devreye girmektedir. Batman, hem eski müttefikini durdurmaya hem de Joker’in açtığı yarayı kapatmaya çalışmaktadır. Karşı karşıya gelen isimler, şehrin sokaklarında şiddetli bir hesaplaşmaya doğru ilerlemektedir.