Metropolis’teki yıkımdan sonra Bruce Wayne, Superman’i insanlık için büyük bir tehdit olarak görmeye başlar. Gotham’da geceye çıkıp kendi yöntemleriyle harekete geçer. Clark Kent ise güçlerinin dünyada yarattığı korkuyu ve baskıyı izler, kendini daha zor bir konumda bulur. Lex Luthor, ikisi arasındaki güvensizliği beslemek için planlar kurar ve çatışmayı körükler. Batman ile Superman karşı karşıya gelir, sert bir hesaplaşma yaşanır. Tam bu sırada Lex Luthor’un daha büyük planı ortaya çıkar. Bruce ve Clark, Diana Prince ile birlikte Doomsday’e karşı savaşmak zorunda kalır. Lois de bu mücadelede önemli bir rol üstlenir.