Çaylak, CIA’ye alınan genç bir adamın eğitim sırasında yaşadığı zorlu sınavları anlatıyor. MIT’den birincilikle mezun olan James Clayton, Walter Burke’un dikkatini çeker ve kendini bir anda ajan adayları arasında bulur. Başta bu teklife mesafeli durur, ama sunulan görevler ve fırsatlar onu ikna eder. CIA merkezinde eğitim başlar, James kuralları öğrenmeye çalışırken baskı da artar. Walter Burke onu sürekli sınar, Zack ve Dennis gibi isimlerle aynı ortamda mücadele eder. Layla Moore ile kurduğu yakınlık da işini zorlaştırır. James, görevlerde hata yapmamak için çabalarken çevresindeki insanlar ve verilen bilgiler onu sürekli test ediyor.