Cesur Balık 2, resifini korumak için köpekbalıklarıyla ve diğer deniz tehditleriyle savaşan Pi’nin hikayesini anlatıyor. Pi, deniz gücünü kullanarak arkadaşlarını korumaya çalışır, ama her saldırıda daha büyük bir tehlikeyle karşılaşır. Tek başına verdiği mücadele onu sürekli zorlar, çünkü hem dış düşmanlarla hem de kendi korkularıyla uğraşır. Cordelia, Ronny ve Junior da onun yanında durur, fakat resifteki huzur kolay kolay sağlanmaz. Pi, yaptığı seçimlerin herkesi etkilediğini fark eder ve her adımında yeni bir risk alır. Düşmanları yaklaşırken, Pi arkadaşlarını kurtarmak için son bir karar vermek zorunda kalır. Peki Pi, resifini koruyup bu mücadeleden sağ çıkabilecek midir?