Komutan Pete Mathews, atom denizaltısını Pasifik sularında yönetir. Deniz altında garip saldırılar başlar, ekip kısa süre sonra radyoaktif bir dev kalamarla karşı karşıya kalır. Pete ve ekibi kurtulmaya çalışırken yaratık yüzeye çıkar, gemilere ve kıyıya saldırır. Prof. Lesley Joyce ile Dr. John Carter, bunun normal bir deniz canavarı değil, atom bombası testleriyle mutasyona uğramış bir kalamar olduğunu anlar. Lesley Joyce'e hayat veren Faith Domergue, bu tehdidin peşine düşen bilim ekibinde yer alır. Donanma önce şüpheyle yaklaşır, ancak saldırılar büyüyünce önlem almak zorunda kalır. Kalamar San Francisco'ya kadar ilerler, Golden Gate Köprüsü zarar görür ve şehirde hasar artar. Sonunda özel bir torpido hazırlanır, Pete Mathews ve askerler yaratığı durdurmak için yeniden suya iner.