Fantastik Canavarlar: Dumbledore'un Sırları, Albus Dumbledore'un Grindelwald'ı durdurmak için Newt Scamander'dan yardım istemesini konu alıyor. Albus, Grindelwald'ın giderek güçlendiğini görür ve Newt'i tehlikeli bir göreve yollar. Newt, yol boyunca Jacob Kowalski ve Credence Barebone ile karşılaşır, eski bağlar yeniden açılır. Grindelwald'ın yanında yer alan tehlikeli yaratıklar işi zorlaştırır. Newt, farklı şehirlerde iz sürer, tuzaklardan kurtulmaya çalışır ve Albus'un desteğiyle ilerler. Credence ise kendi yerini ararken çatışmalar büyür, grup her adımda yeni bir engelle karşılaşır.