Dünya çapında yayılan gizemli bir virüs, insanlığın sonunu getirmenin eşiğine gelir. Fox Mulder ve Dana Scully, Washington'da iz peşine düşer, hastalığın kaynağını araştırır ve bunu durdurmak için zamanla yarışır. Araştırmaları onları gizli hükümet bağlantılarına, riskli bir laboratuvara ve doktor Alvin Kurtzweil'ın peşinden götürür. Fox Mulder, elindeki ipuçlarını birleştirirken Dana Scully, bulaşın izini sürer ve kendi hayatını da tehlikeye atar. Walter Skinner yardım etmeye çalışır, ama onları izleyen gölgeler her adımda daha da yaklaşır. Filmin kadrosunda David Duchovny, Gillian Anderson, Mitch Pileggi, William B. Davis ve John Neville yer alıyor.