İkizler Projesi, Henry Brogan’ın peşine düşen genç bir suikastçıyla verdiği hayatta kalma mücadelesini anlatıyor. Henry, görevden çekilip sakin bir hayat kurmaya çalışırken birden hedef haline geliyor. Peşindeki kişi onu adım adım izliyor, saldırılarını önceden tahmin ediyor ve Henry’yi zor durumda bırakıyor. Bu av sırasında Danny Henry’ye yardım ediyor, Baron ise izleri toparlamaya çalışıyor. Clay Verris bu kovalamacanın arkasındaki isim olarak öne çıkıyor. Jack Willis de olayların içine girince Henry, kendi geçmişinden gelen bu tehditle yüzleşmek zorunda kalıyor.