Incident at Montauk, Montauk’ta görülen bir UFO’nun ardından gizli bir hükümet işine giren bir adamın hikayesini anlatıyor. Jed Logan, Long Island’ın Montauk bölgesinde yaşadığı bu tuhaf karşılaşmayı araştırır. İz sürdükçe Montauk Soldier #1 ve Montauk Soldier #2 ile yolu kesişir, çevresindeki koruma hattı sıkılaşır. Conspiracy Theorist, ona yeni ipuçları verir ama her adımda risk büyür. Jed Logan, güvenilir sandığı kişilere şüpheyle bakmaya başlar. Soruşturma ilerledikçe karşısına çıkan bilgiler çoğalır, gördüğü şeyler bildiği hayatı sarsar. Ona açılan kapılar yeni bir gerçeğe götürür, ama bu yol kolay değildir.