Jack ve Mekanik Kalp, kalbi yerine bir saatle yaşayan Jack’in büyürken aşkı ve korkuyu aynı anda öğrenmesini anlatıyor. Jack, doğduğu gece hayatta kalır ve Mélies onu saat mekanizmasıyla yaşatır. Yıllar geçerken Jack, Miss Acacia’ya tutulur. Onu görmek için yol arar, ama Joe karşısına çıkar ve işleri zorlaştırır. Jack okuldan uzak kalır, duygularını saklamaya çalışır, fakat Miss Acacia’ya yaklaşmak istedikçe kalbindeki saat daha çok sorun çıkarır. Joe, Jack’in peşini bırakmaz. Jack ise Méliès’in evinde ve yolda geçen bu süreçte, kendi bedenine bağlı bu tuhaf hayatla baş etmeye çalışır.