Karantina, üniversitede başlayan ölümcül bir salgınla birlikte cinayet soruşturmasının ortasında kalan Zeynep’in yaşadıklarını anlatıyor. Zeynep, okula yeni başladığı gün kampüsün kapatılmasıyla içeride mahsur kalmaktadır. Aynı saatlerde bir öğrencinin öldürülmesi, okulda korkuyu büyütmektedir. Karantinaya alınan kampüste öğrenciler birbirinden şüphe etmeye başlamaktadır. Zeynep, bu ortamda Baran ile yakınlaşırken, hem ona güvenip güvenemeyeceğini anlamaya çalışmaktadır hem de cinayetin izini sürmektedir. Ender Zorlu, Onur Zorlu, Deniz Uğur ve Erdinç Gülener’in de yer aldığı hikaye, Zeynep’in hayatta kalma mücadelesini ve kalbinin sesini takip etme çabasını izlemektedir.