Kayıp Kızlar'de, Kim, Bella ve Momo sıradan bir günün ortasında büyülü bir çiçeğin nektarını içer ve kısa süreliğine erkek bedenlerinde yaşamaya başlar. Kim, yeni haliyle okula ve sokağa daha rahat karışmaya çalışır, Bella çevresindekilerin ona nasıl davrandığını yoklar, Momo ise bu değişimi fırsata çevirip farklı ortamlara girer. Üçü, erkek olarak dolaşırken kendilerine kurulan bakışları, konuşmaları ve sınırları yakından fark eder. Ancak bu deneyim, beklediklerinden daha çok sorun çıkarır. Kim ve arkadaşları, hem yeni kimliklerini korumaya hem de bu tuhaf dönüşümün içinden çıkmaya çalışır. Peki bu macera, onları geri dönüşü zor bir yola mı götürür?