Köstebek, Jeffrey Wigand’ın tütün şirketindeki gizli bilgileri açıklamaya karar vermesiyle başlayan baskı ve mücadele hikayesini anlatıyor. Lowell Bergman, bu bilgileri ortaya çıkarmak için Jeffrey ile görüşür ve onu konuşmaya ikna etmeye çalışır. Jeffrey, çalıştığı şirketin sigara bağımlılığını bildiğini ve bunu gizlediğini öğrenir. Bu sırada Jeffrey’nin ailesi de baskı altına girer, evindeki huzur bozulur. Lowell, yayıncılarla ve şirket avukatlarıyla uğraşırken Jeffrey’yi korumaya çalışır. Mike Wallace ve Don Hewitt de bu haberi yayınlayıp yayınlamama konusunda karar vermek zorunda kalır. Jeffrey, doğruyu söylemek ile ailesini korumak arasında sıkışır.