Müzik Kutusu, genç avukat Ann Talbot’un babasının geçmişiyle yüzleşirken ailesi ile mesleki sorumluluğu arasında kaldığı hikayesini anlatıyor. Ann, babası Mike Laszlo’nun savaş sonrası Macaristan’dan kaçıp Amerika’ya yerleştiğini öğrenir. Ancak bu adamın aslında aranan bir savaş suçlusu olduğu ortaya çıkar. Ann, bu gerçeği saklamak ile açığa çıkarmak arasında sıkışır. Eşi Harry ve oğlu Mike, onu desteklemeye çalışsa da karar vermesi kolay olmaz. Georgine Wheeler’ın yürüttüğü soruşturma derinleştikçe Ann’in babasını koruma isteği daha da zorlaşır. Peki Ann, hem babasıyla bağını koruyup hem de adaleti yerine getirebilecek midir?