Nietzsche Ağladığında, Josef Breuer ile Nietzsche arasında Viyana’da gelişen tuhaf görüşmeleri anlatıyor. Lou Salome, Josef Breuer’in kapısını çalar ve Nietzsche’nin ağır bir bunalım yaşadığını söyler. Bunun üzerine Josef Breuer, Nietzsche ile tanışmayı kabul eder. İlk buluşmada Josef Breuer ile Nietzsche birbirini dikkatle dinler, sonra konuşmalar uzar. Nietzsche’nin sözleri Josef Breuer’in düzenli hayatını sarsar. Josef Breuer kendi hastalarıyla uğraşırken, Nietzsche ile görüşmeleri de sürer. Bu sırada genç Sigmund Freud da çevrede yer alır. Josef Breuer, Nietzsche ve Lou Salome arasındaki ilişki giderek karmaşıklaşır.