Nil'in İncisi, Joan'ın Orta Doğu'da alıkonulmasının ardından Jack ile Ralph'in onu kurtarmak için çıktığı macerayı anlatıyor. Joan, bir şeyhin davetini kabul ederek bölgeye gidiyor. Ancak kısa süre sonra burada tutuklanıyor ve hareket edemez hale geliyor. Jack, Joan'dan haber alınca vakit kaybetmeden Ralph ile yola çıkıyor. İkili, çölde ve şehirde iz sürüyor, doğru kişilere ulaşmaya çalışıyor. Omar ve Jewel da bu arayışın içinde karşılarına çıkıyor. Jack, Joan'a ulaşmak için her adımda yeni bir engelle yüzleşiyor. Ralph ise çoğu zaman işi kolaylaştırmak yerine daha da karıştırıyor.