Jesse, Randolph ile birlikte Pasifik Okyanusu’nun kuzeybatı sularında balinaların peşine düşer. Bu yolculukta Jesse, balinalara merak duyan Max ile tanışır. İkisi kısa sürede Willy için birlikte hareket eder. Ancak bölgede balinaları ve ailelerini tehdit eden insanlar vardır. Jesse, Randolph ve Max, Willy’yi korumak için adım atar. John Wesley’nin planları, balinaların güvenliğini daha da zorlar. Drew Halbert de bu mücadelede karşılarına çıkan isimlerden biri olur. Jesse, Willy’nin yanında kalır ve onu tehlikeden uzak tutmaya çalışır.