Polis Akademisi 6: Şehir Kuşatma Altında'te, Wilson Heights çetesi şehrin sokaklarını kontrol altına almaktadır. Liderleri uzun süredir izini kaybettirmiştir ve polisler bu kişinin kim olduğunu çözmeye çalışmaktadır. Yasaları hiçe sayan çete, mahallelerde baskı kurmaktadır. Bu düzeni bozmak için Polis Akademisi ekibi göreve çağrılmaktadır. Başında Hightower’ın olduğu ekipte Tackleberry, Jones, Callahan ve Hooks da yer almaktadır. Çılgın polisler, kurallara bağlı kalmadan iz sürmekte ve çetenin adamlarını tek tek sıkıştırmaktadır. Ancak attıkları adımlar sık sık aksamakta, planları ters gitmektedir. Buna rağmen şehrin sokaklarında peşlerini bırakmamaktadırlar ve suçluların alanını daraltmaya çalışmaktadırlar.