Prodigy, Fonda ile Ellie arasında geçen tehlikeli zihin savaşını konu alıyor. Fonda, Ellie’nin davranışlarını incelemeye başladığında onun yalnızca zeki bir genç kız olmadığını fark etmiştir. Seanslar ilerledikçe Ellie, sorulara kaçamak yanıtlar vermektedir. Fonda ise her görüşmede daha fazla ayrıntı toplamaya çalışmaktadır. Olivia ve Birch, bu süreçte yaşananları yakından izlemektedir. Keaton da olaylara dahil oldukça baskı artmaktadır. Fonda, Ellie’nin geçmişine indikçe bazı izlerin bugüne taşındığını görmüştür. Ellie’nin sakladığı güç, görüşmeleri daha tehlikeli hale getirmektedir. Fonda, kontrolü elinde tuttuğunu sanmıştır. Ancak karşısındaki zihin, onun hesaplarını boşa çıkarmaya başlamıştır.