Sakkara'nın Sırları, Mısır'da 4400 yıldır açılmamış bir mezarı inceleyen arkeologların çalışmalarını anlatıyor. Salima Ikram ve ekip, mezarın girişini açıp içeri giriyor, duvarlarda ve odalarda kalan izleri tek tek kaydediyor. Buldukları kalıntılar, heykeller ve eşyalar, buranın nasıl kullanıldığını anlamalarına yardım ediyor. Ancak dar alanlar, toz ve karanlık, çalışmayı zorlaştırıyor. Her yeni odada başka bir ipucu çıkıyor, ekip de bunları birleştirmeye çalışıyor. Salima Ikram, buluntuları değerlendirirken geçmişte bu mezarda yaşayanların izini sürüyor.