Batman, Scooby-Doo ve ekibini kukla hırsızların dolaştığı, hayalet söylentilerinin yayıldığı bir bölgeye çeker. Scooby-Doo, Shaggy, Velma ve Daphne, burada tuhaf izleri takip eder ve karşılarına çıkan tehlikeden kurtulmak için bir plan kurar. Şans da yanlarında olur ve işleri çözüme yaklaştırır. Batman, bu olayın ardından onlara önemli bir teklif sunar. Ekip, Batman'in çözülemeyen bir davasına yardım etmeyi kabul eder ve birlikte yeni bir soruşturmanın içine girer. Scooby-Doo ve arkadaşları, ipuçlarını toplarken kukla hırsızlarının peşine düşer ve bölgedeki korku havasını dağıtmaya çalışır.