Sığınak 2'te, bir grup araştırmacı ve asker terk edilmiş bir Nazi sığınağına girer, çünkü II. Dünya Savaşı'ndan kalan ölümcül bir orduyu ele geçirme tehlikesi vardır. Lena rolüyle Catherine Steadman ve Wallace rolüyle Richard Coyle, içeride gördükleri laboratuvar kalıntıları ve yaralı bedenler karşısında ekibin yönünü belirlemeye çalışır. Hall ve Macavoy da dar koridorlarda ilerlerken devreye girer, fakat sığınak kısa sürede onların kontrolünden çıkar. Eski deneylerin izleri, duvarların ardında hâlâ canlıdır ve ekip her adımda daha sert bir tehditle yüzleşir. Carlise ve diğerleri, bu karanlık yapıda hem hayatta kalmaya hem de içerideki gücü dışarı çıkmadan durdurmaya çalışır.