Tehlikeli Yaratıklar, New York'ta çocukları tehdit eden bulaşıcı bir hastalığı durdurmaya çalışan Susan ve Peter'ın hikayesini anlatıyor. Susan, hastalığı taşıyan böceklere karşı yeni bir tür üretir ve buna Judas adını verir. Bu canlılar kısa sürede yer altındaki kanalizasyonlara yayılır. Susan ile Peter, Chuy ve Manny ile birlikte örnekleri izlemeye başlar. Ancak Judas larvaları büyüyor, insanları taklit eden yapılarıyla kentin içinde dolaşıyor. Leonard da bu tehlikenin ortasında kalıyor. Susan, yaratıkları bulmak için şehrin karanlık tünellerine iner ve ekip, onlarla karşı karşıya gelir.