Kirk, Spock ve McCoy, Atılgan ile görevdeyken acil bir çağrı alır. Volkanlılar onları ele geçirir ve Büyük Bariyer’in ötesine geçmek ister. Kirk, Spock ve McCoy kısa sürede serbest kalır, Atılgan yeniden rotaya girer. Mürettebat, bilinmeyen bölgeye doğru ilerlerken Klingonlar da peşlerine düşer. Yolculuk sırasında farklı ırklar aynı hedefte buluşur. Kirk, Spock ve McCoy, orada karşılarına çıkan güçlü varlıkla yüzleşir. Bu varlık, kendini Tanrı gibi gösteren bir güç taşır. Mürettebat, hayatta kalmak ve dönüş yolunu bulmak için birlikte hareket eder.