Çatı Katı, yeni evlerine taşınan bir çiftin, yaşlı ev sahibesi yüzünden bin bir uğraşla evlerini korumaya çalışmasını anlatıyor. Alex Rose ile Nancy Kendricks, Drew Barrymore’un Nancy Kendricks’i ve Ben Stiller’ın Alex Rose’u, şehirde hayalini kurdukları eve yerleşir. Ancak evin üst katında oturan Mrs. Connelly, onları rahat bırakmaz ve evden gitmeleri için her yolu dener. Alex ve Nancy önce sabreder, sonra evi elde tutmak için plan yapar. Fakat her yeni adımda başka bir sorun çıkar. Bu mücadele uzadıkça ikisi de evin masrafını, yükünü ve ilişkilerini yeniden düşünmeye başlar. Evin içinde yaşananlar, onların günlük düzenini iyice zorlar.