Evde Tek Başına 3'te, Alex Pruitt su çiçeği yüzünden evde kalır ve yanlışlıkla uluslararası bir suç örgütünün aradığı özel bir mikroçip taşıyan oyuncak arabayı bulur. Peter Beaupre, Alice Ribbons, Burton Jernigan ve Earl Unger, çipi geri almak için evin çevresinde dolaşmaya başlar. Alex, durumu fark edince evi kendi bildiği gibi hazırlamaya koyulur ve kapılara, koridorlara, odalara tuzaklar kurar. Suçlular içeri girmeye çalıştıkça ardı ardına engellerle karşılaşır, planları bozulur. Alex, çevresindekilerle bağlantı kurup elindeki ipuçlarını toplar ve suçluların izini sürer. Evde geçen bu mücadelede Alex, kendini ve ailesini korumak için sürekli yeni yollar bulur.