Kei Kurono, Tokyo’da sıradan bir gün geçiren genç bir adamdır. Metro raylarında birini kurtarmaya çalışırken, Kei ve arkadaşı Masaru Kato kendilerini tuhaf bir odada buluyor. Ortadaki siyah küre onlara sert görevler veriyor, dünyada saklanan uzaylıları bulup avlamalarını istiyor. İlk görevlerde ne yapacaklarını bilemiyorlar, ama hayatta kalmak için birbirlerine yaslanıyorlar. Bu sırada başında Ninomiya Kazunari’nin olduğu ekip, Natsuna’nın Kei Kishimoto’su ve Hongou Kanata’nın Joichiro Nishi’si ile birlikte farklı sokaklarda, binalarda ve kapalı alanlarda yaratıkların peşine düşüyor. Her karşılaşma yeni bir tehlike getiriyor, ekip de kimseye tam olarak güvenemeden ilerliyor.