Gökkuşağı Savaşçıları'te, 1930 yılında Tayvan'ın Nantou ve Hualien bölgelerinde Seediq halkı Japon sömürge yönetimine karşı ayağa kalkar. Mona Rudao, köyleri toplar ve insanlarını topraklarını korumaya çağırır. Halk, dağlara çekilir, ormanlarda saklanır ve baskıya rağmen geleneklerini yaşatmaya çalışır. Japon askerleri bölgeyi sıkı şekilde denetler, çatışmalar giderek sertleşir. Chih-Hsiang Ma'nın Temu Walis'i, bu direnişin içinde yer alır ve savaşın yükünü omuzlar. Genji Kojima ile General Yahiko Kamada, Seediq'leri bastırmak için harekete geçer. Obing Tadao, iki dünya arasında sıkışan bir yüz olarak öne çıkar. Seediq'ler, onur ve hayatta kalma arasında seçim yapmak zorunda kalır.