Hayalet Avcıları'te, on bir yaşındaki Tom karanlıktan korktuğu sanıldığı için ailesini endişelendirmektedir. Oysa Tom, Hugo adında zararsız bir hayaletle konuşmaktadır. Şehrin üstüne tehlikeli bir buzul hayaleti yaklaşınca, profesyonel hayalet avcısı Hetty durumu fark etmektedir. Tom, Hugo ve Hetty, bu tehdidi durdurmak için birlikte yola çıkmaktadır. Yol boyunca buzla kaplı tehlikeli alanlardan geçmekte, peşlerine düşen engelleri aşmaya çalışmaktadırlar. Tom korkusuyla yüzleşirken Hugo da hayalet dünyasındaki bilgisiyle ekibe yardım etmektedir. Hetty ise deneyimiyle onları yönlendirmektedir. Üçlü, yeni bir buzul çağı başlamadan önce hayaletin izini sürmektedir.