Shinichi, okul yolunda bedenine yerleşen bir parazit yüzünden hayatı altüst olur. Migi adlı bu varlık, onunla birlikte yaşamayı kabul eder ve Shinichi’yi diğer parazitlere karşı korumaya çalışır. Tokyo’da insanlar fark etmeden avlanırken, Shinichi okuluna gider, arkadaşlarıyla görüşür ve aynı anda hayatta kalmak için savaşır. Murano, onun davranışlarındaki değişimi fark eder. Ryoko, Hideo ve diğer parazitler ise insanları izler, saldırılar düzenler ve Shinichi’nin peşine düşer. Shinichi ile Migi, her karşılaşmada daha sert kararlar almak zorunda kalır. Bir yanda okul yaşamı sürerken, öte yanda ölümcül çatışmalar yaklaşır.