Lama Norbu, ölen Budist liderlerin ardından yeni bir Buddha'nın yeniden doğduğuna inanır. Bu yüzden Hindistan'dan bir kız çocuğu, Seattle'dan Jesse ve Katmandu'dan bir çocukla birlikte yolculuğa çıkar, kutsal Butan'a gider. Yol boyunca hepsi farklı işaretlerin peşine düşer, aileleri de kendi kaygılarıyla bu arayışa karışır. Ortalarda Keanu Reeves'in oynadığı Siddhartha, Jesse'ye Buddha'nın yaşamını ve öğretilerini anlatır. Lama Norbu ise gerçek Küçük Buddha'yı bulmak için çocukları sınar, onlardan gelen işaretleri dikkatle izler. Yolculuk ilerledikçe herkes, inanç ile aile bağları arasında zor kararlar vermek zorunda kalır.