Parlayan Hançerler, 800'lü yıllarda Çin'de, isyancı Uçan Hançerler Evi ile imparatorluk güçleri arasındaki kovalamacayı anlatıyor. İmparatorluk zayıflarken Leo ve Jin, kaybolan örgüt liderini bulmak için görevlendirilir. Jin, savaşçı kılığına girer ve iz sürerken Xiao Mei ile yakınlaşır. O sırada Gum Sing Mo'nun Jin'i, arayışını gizli tutmaya çalışır, Andy Lau Duk-wah'ın Leo'su ise ona baskı yapar. Xiao Mei, Jin'e giderek daha çok güvenmeye başlar, ancak bu yakınlık iki tarafın planlarını zorlaştırır. Leo, Mei'nin peşini bırakmaz. İmparatorluk askerleri, ormanlar ve gizli yollar arasında aradıkları kişilere yaklaşırken, Jin'in görevi ile hisleri çatışır.