Tokyo Sonata, işini kaybeden bir babanın ardından dağılmaya başlayan bir Japon ailesinin yaşadıklarını anlatıyor. Ryuhei, işsiz kaldığını evdekilerden saklamaya çalışır ve her gün sanki işe gidiyormuş gibi evden çıkar. Megumi, evin masrafını çevirmek için çabalarken evdeki huzursuzluğu fark eder. Kenji, gizlice piyano dersleri almaya başlar ve kendi yolunu bulmaya çalışır. Takashi ise okul ve ev arasındaki baskıyla uğraşır. Aile içinde konuşmalar azalır, küçük yalanlar büyür. Herkes bu yeni düzene uyum sağlamaya çalışırken evdeki bağlar sınanır. Kaneko da bu kırılgan düzenin içinde yerini alır.