Trübe Wolken, Paul’un merak ettiği gizli yollar ve terkedilmiş yerler yüzünden kendini beklenmedik bir olayların içinde bulmasını anlatıyor. Paul, 17 yaşındadır ve çevresindeki tuhaf ayrıntılara takılır. Bir gün yeni tanıştığı gençlerle bir araya gelir, onların peşinden gidiyor ve merakı daha da büyür. Paul, tanımadığı bir dünyanın içine adım atar. Erich, Dala, Per-Ulrich ve Sylvia ile ilişkileri değişmeye başlar. Evde ve dışarıda duyduğu sözler onu düşündürür. Paul, neye inandığını ve kime güveneceğini sorgular. Günler ilerlerken etrafındaki hava ağırlaşır, Paul’un hayatı beklenmedik biçimde yön değiştirir.