Yeşil Kobra, Francisco Manoel da Silva adlı bir adamın köle plantasyonunda başlayan ve onu Afrika’da tek başına bırakan zor bir yolculuğu anlatıyor. Cobra Verde, bir plantasyonda işlerin düzeninden sorumlu olur. Ancak plantasyon sahibi, onun genç kızlarla yakınlaştığından şüphelenir. Onu öldürmek yerine Afrika’ya yollar. Francisco orada yabancı kalır, çevresindeki insanlar ona sert davranır. Taparica, Don Octavio Coutinho, Captain Fraternidade ve Bernabé ile karşılaşır. Her gün aşağılanma, korku ve yalnızlık içinde geçer. Cobra Verde, hem ayakta kalmaya hem de aklını korumaya çalışır.