Yüzündeki Sır, savaş sonrası Nelly ile Johnny’nin yeniden karşılaşmasını ve kimlik arayışını anlatıyor. Nelly, toplama kampından sağ çıkar ve yüzündeki ameliyatlarla eski haline yaklaşır. Berlin’e döner ve Lene’nin yardımıyla hayatını toparlamaya çalışır. Ardından Johnny’nin karşısına çıkar, ama Johnny onu tanımaz. Nelly, onun geçmişteki davranışlarını ve gerçek duygularını anlamaya çalışır. Johnny ise önünde duran kadının Nelly olduğunu fark etmeden onunla bir plan yapar. Bu yakınlık, Nelly’yi hem geçmişiyle hem de Johnny’ye dair şüpheleriyle baş başa bırakır.