Burakku Rokku Shuta, bir ortaokul öğrencisinin dostluk ile başka bir dünyadaki ölüm kalım savaşı arasında bölünen hikayesini anlatıyor. Mato Kuroi, saf ve içine kapanık bir öğrencidir, Yomi Takanashi ile yakın bir bağ kurmuştur. Ancak ikinci sınıfa geçtiklerinde araları açılmaya başlamıştır. KanaHana'nın oynadığı Mato Kuroi, günlük hayatta sessizce yol almaya çalışırken, Miyuki Sawashiro'nun oynadığı Yomi Takanashi de kendi yükünü taşımaktadır. Aynı sırada, başka bir dünyada Black Rock Shooter adıyla bilinen bir savaşçı çatışmanın içine girmiştir. İki taraf da kendi sınavını vermektedir, biri okulda, diğeri karanlık bir savaş alanında. Yuu Koutari ise çevresindeki olayları daha da karmaşık hale getirmektedir. Hikaye, bu iki dünyanın birbirine temas ettiği anlarda ilerlemektedir.