Manitas del Monte, Meksika’nın güçlü bir uyuşturucu kartelinin başında duran bir adamdır. Yıllardır sakladığı kimliği değiştirme isteğini hayata geçirmek için avukat Rita’dan yardım ister. Rita, Manitas’ın ölümünü sahte biçimde düzenler ve onun Emilia Pérez adıyla yeni bir hayata başlamasını sağlar. Bu sırada Zoe Saldaña’nın Rita’sı, işin hukuki tarafını yürütürken baskı altında kalır. Karla Sofía Gascón’un Emilia’sı ise geçmişinden kopmaya çalışır ama eski hayatının gölgesi peşini bırakmaz. Jessi, Gustavo Brun ve Epifanía da bu yeni düzenin içinde yer alır. Emilia hem yeni kimliğiyle yaşamaya alışır hem de çevresindeki insanlarla ilişkisini yeniden kurmaya çalışır.