Gizli Bahçe'te, Mary Lennox ailesini kaybettikten sonra Hindistan’dan İngiltere’ye, amcası Lord Archibald Craven’ın Yorkshire’daki malikânesine gönderilmektedir. Soğuk ve sessiz evde yeni hayatına alışmaya çalışmaktadır. Mary, hizmetçi Mrs. Medlock’un gözetiminde dolaşırken Colin’le tanışmaktadır. Colin hastadır ve neredeyse hiç dışarı çıkmamaktadır. Mary, Billy’nin yardımıyla bahçede gizli bir kapı bulmaktadır. Kapının ardında, uzun zamandır kapalı kalan unutulmuş bir bahçe yer almaktadır. Mary ve Colin, bu alanı yeniden canlandırmak için çalışmaya başlamaktadır. Çiçekler açarken çocukların da güçlendiği görülmektedir.