Kuzeydeki Casus, Güney Koreli bir ajanının Kuzey Kore’de yürüttüğü gizli görev sırasında siyasi oyunların içine düşmesini anlatıyor. 1990'ların ortasında Heuk Geum-seong, askeri ve siyasi çevrelerin yakından takip ettiği bir görev için Kuzey’e gider. Orada Ri Myeong-woon ile temas kurar, Choi Hak-seong ve Section Chief Jeong Moo-taek gibi isimlerin gölgesinde hareket etmeye çalışır. Hwang Jung-Min'in oynadığı Heuk Geum-seong, bilgi toplarken hem üstlerinden hem de karşısına çıkan insanlardan şüphe duymaya başlar. Lee Hong-seol ile kurduğu ilişki de işini daha zor hale getirir. Her adımında geçmişiyle yüzleşir, kime güveneceğini bilemez ve yanlış bir kararın bedelini ağır ödemek zorunda kalır. Bu çıkmazdan kurtulmayı başarabilecek midir?