İçimdeki Hayalet'te, Allen kız arkadaşına saldıran adamı öldürdükten sonra akıl hastanesine kapatılır. Burada akli dengesi bozuk suçlular arasında kalır ve çevresindeki tehlikeli insanlara karşı tetikte durur. En büyük sorunu, kafasının içinden yükselen seslerdir. Bu sesler onu zaman zaman yanlış kararlara iter. Allen, hastane koridorlarında kendini korumaya çalışırken aklını da kontrol altında tutmaya uğraşır. Nick Stahl'ın Allen Meneric'i, bu kapalı dünyada yalnızca dışarıdaki tehditle değil, kendi zihnindeki baskıyla da mücadele eder. Mia, Carl ve Ben ile karşılaştıkça, hastanede ayakta kalmanın yolu daha da zorlaşır. Dr. Lofton ise onun durumunu izler ve Allen için her gün yeni bir sınav başlar.